Krootuse Lasteaed avati 1961. aastal.

1. septembrist 2012  jätkas lasteaed oma tegevust uutes renoveeritud ruumides Krootuse Kooli hoones.

17. aprillist 2018 - 31. august 2024 kandis lasteaed nimetust Krootuse Lasteaed Pesapuu. Alates 01. septembrist 2024 ühines lasteaed Krootuse Põhikooliga ja uus asutus on Krootuse Kool.

Lasteaias töötab kaks rühma: Sipelgad (liitrühm) ja Sajajalgsed (aiarühm). Töö- ja mängukeskkonnaks on valgusküllased, avarad ja kaasaegselt sisustatud ruumid. Lasteaial on looduskaunis ümbrus, lähedal uuendatud vana mõisapark, laululava, virgestusrada, tegutsemisvõimalusi pakkuv suur ja turvaline õueala, kooli staadion ning võimla – suurepärane lapsesõbralik kasvukeskkond. 

Laste vastuvõtt ja nende väljaarvamine lasteaiast toimub Kanepi Vallavalitsuse poolt kehtestatud tingimustel ja korras. Laps võetakse lasteaeda vastu, kui lapse elukohana on Eesti rahavastikuregistrisse kantud Kanepi vald. Vabade kohtade olemasolul võetakse lasteaeda lapsi ka väljaspoolt valla teeninduspiirkonda. Lapse lasteaeda vastuvõtmine toimub lapsevanema või selleks volitatud isiku kirjaliku lasteaiakoha taotluse esitamisel lasteaia direktorile. 

Vastavalt Kanepi Vallavolikogu 10.10.2024 määruse „Kanepi valla koolieelsetes munitsipaallasteasutustes lapsevanema poolt kaetava osa ja toidukulu tasumise kord“ lasteaia osalustasu on 10 € kuus. Osalustasu ei pea tasuma, kui lapse ja vähemalt ühe vanema elukohaks on registreeritud Kanepi vald.

Määruse kohaselt tasub lapse toidukulu täies ulatuses lapsevanem. Krootuse Kooli lasteaed Pesapuu toidupäeva maksumus on 2.20 €. Lapse puudumisel mistahes põhjusel tehakse ümberarvestus alates lapse puudumisest teavitamisele järgnevast päevast. Teatada tuleb ELIIS-i kaudu. Toidukulu arvestatakse eelmises kalendrikuus lasteaias kohal käidud päevade eest. Toidukulu tuleb vanemal tasuda iga kuu 20. kuupäevaks vallavalituse poolt esitatud arve alusel.  

Kui ühest leibkonnast käib samal ajal lasteaias kolm või enam last ja nii lasteaias käivate laste ja vähemalt ühe vanema Eesti rahvastikuregistri järgne elukoht on Kanepi vald, on toidukulu tasumisest vabastatud kolmas ja enam laps.